FASTA

Formato baseado em texto para representar tanto sequências de nucleotídeos quanto sequências de aminoácidos, no qual os nucleotídeos ou aminoácidos são representados usando códigos de uma única letra. O formato também permite sequências de nomes e comentários precedendo as sequências. A simplicidade do FASTA torna mais fácil manipular e analisar sequências usando ferramentas de processamento de texto e linguagens de script.

>NC_005248.1:3950-4810 Escherichia coli plasmid pIGAL1, complete sequence
ATGAGTATTCAACATTTCCGTGTCGCCCTTATTCCCTTTTTTGCGGCATTTTGCCTTCCTGTTTTTGCTC
ACCCAGAAACGCTGGTGAAAGTAAAAGATGCTGAAGATCAGTTGGGTGCACGAGTGGGTTACATCGAACT
GGATCTCAACAGCGGTAAGATCCTTGAGAGTTTTCGCCCCGAAGAACGTTTTCCAATGATGAGCACTTTT
AAAGTTCTGCTATGTGGCGCGGTATTATCCCGTGTTGACGCCGGGCAAGAGCAACTCGGTCGCCGCATAC
ACTATTCTCAGAATGACTTGGTTGAGTACTCACCAGTCACAGAAAAGCATCTTACGGATGGCATGACAGT
AAGAGAATTATGCAGTGCTGCCATAACCATGAGTGATAACACTGCGGCCAACTTACTTCTGACAACGATC
GGAGGACCGAAGGAGCTAACCGCTTTTTTGCACAACATGGGGGATCATGTAACTCGCCTTGATCGTTGGG
AACCGGAGCTGAATGAAGCCATACCAAACGACGAGCGTGACACCACGATGCCTGCAGCAATGGCAACAAC
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AGTTATCTACACGACGGGGAGTCAGGCAACTATGGATGAACGAAATAGACAGATCGCTGAGATAGGTGCC
TCACTGATTAAGCATTGGTAA

• Uma sequência em formato FASTA começa com uma descrição de uma única linha, seguida por linhas de dados em sequência;
• A linha de descrição se distingue a partir da sequência dos dados pelo símbolo ">" na primeira coluna;
• Recomenda-se que todas as linhas do texto sejam mais curtas do que 80 caracteres.